ZS został reaktywowany po III Kongresie KPN w marcu 1989. Jego nazwa i idea nawiązywała do organizacji piłsudczykowskiej, działającej w latach 1919-1939, nawiązującej z kolei do tradycji Związku Strzeleckiego z lat 1910-1914. Na przełomie lipca i sierpnia 1989 zorganizowano kurs instruktorsko-medyczny w Juszczynie (Beskid Makowski), w parafii ks. Adolfa Chojnackiego, pod kierunkiem kpt. rezerwy Włodzimierza Olszewskiego. Uczestniczy kursu (ok. 30 osób) 5 sierpnia tr. przybyli do Krakowa, aby uczestniczyć we mszy na Wawelu. Przy grobie Marszałka nastąpiło symboliczne przekazanie "maciejówki" nowemu pokoleniu. Następnego dnia (6 sierpnia 1989) ZS został nadany statut, a młodzi strzelcy wyruszyli na pierwszą kadrówkę z ich  oficjalnym udziałem. Wskutek przeszkód formalnych (władze obawiały się, że reaktywacja ZS jest wstępem do próby siłowego przejęcia władzy przez KPN) Związek został zarejestrowany  dopiero 13 czerwca 1990 w Sądzie Wojewódzkim w Warszawie.

Zgodnie ze Statutem z 1989 na czele ZS stała Główna Kwatera na czele z Komendantem Głównym, jego zastępcą oraz szefem sztabu Kwatery Głównej. Każdorazowym Komendantem Głównym ZS był przewodniczący KPN.

Pierwszym Komendantem Głównym odrodzonego ZS został Leszek Moczulski, Szefem Sztabu (zarazem zastępcą Komendanta) - płk Stanisław Dronicz. Kolejnymi Szefami Sztabu byli: mjr. rez. płk. ZS Włodzimierz Olszewski a od 1994 - Andrzej Kaźmierczak (kpt. ZS), który po rozłamie w KPN w 1996 został Komendantem Głównym ZS.

Tymczasem 8 sierpnia 1990 z inicjatywy MON (ministrem był wówczas Janusz Onyszkiewicz, jego zastępcą - Bronisław Komorowski) zarejestrowana została  konkurencyjna organizacja  strzelecka, której oficjalna nazwa brzmiała "Strzelec" - Organizacja Społeczno-Wychowawcza. Jej założycielami zostali byli członkowie... KPN: Wiesław Gęsicki (pierwszy Komendant "Strzelca" - OSW), Michał Wnuk i Danuta Laskus.  1 marca 1991 z inicjatywy ówczesnego ministra ON Romualda Szeremietiewa  organizacja ta zjednoczyła się z kilkoma innymi, mniejszymi organizacjami strzeleckimi tworząc Związek Strzelecki "Strzelec" - OSW (pod taka nazwą organizacja ta istnieje do dziś).

Zob. rozmowę Przemysława Wywiała z Leszkiem Moczulskim na temat odrodzenie Związku Strzeleckiego. 

Juszczyn 1989. Autor fotografii nieznany Juszczyn 1989. Fot. Jarosław Hajduk Juszczyn 1989. Fot. Jarosław Hajduk